Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USP18Q9UMW8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USP18Q9UMW8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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