Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB23Q9ULC3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms