Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NRXN1Q9ULB1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NRXN1Q9ULB1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms