Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RARRES3Q9UL19 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RARRES3Q9UL19 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms