Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEFF2Q9UIK5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms