Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCN11AQ9UI33 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms