Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GPN3Q9UHW5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms