Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms