Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFT172Q9UG01 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT172Q9UG01 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms