Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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