Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL42Q9P2K6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL42Q9P2K6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms