Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCMF1Q9P0J7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
KCMF1Q9P0J7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms