Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VSX1Q9NZR4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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