Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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FAM53CQ9NYF3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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FAM53CQ9NYF3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FAM53CQ9NYF3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
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FAM53CQ9NYF3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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FAM53CQ9NYF3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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FAM53CQ9NYF3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM53CQ9NYF3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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