Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GDAP2Q9NXN4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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