Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC52A1Q9NWF4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC52A1Q9NWF4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms