Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ASF1BQ9NVP2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms