Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CENPMQ9NSP4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms