Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CMC2Q9NRP2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms