Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC31BQ9NQW1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC31BQ9NQW1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms