Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACKR4Q9NPB9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACKR4Q9NPB9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms