Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ARFGAP3Q9NP61 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms