Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOBEC3GQ9HC16 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3GQ9HC16 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms