Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LNPKQ9C0E8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms