Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UPF3BQ9BZI7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UPF3BQ9BZI7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms