Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R3Q9BXE9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms