Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC94Q9BW85 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms