Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NDFIP1Q9BT67 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms