Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMSS1Q9BQ75 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms