Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PLIN4Q96Q06 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PLIN4Q96Q06 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms