Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC85AQ96PX6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms