Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLRP3Q96P20 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms