Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC43Q96MW1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC43Q96MW1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms