Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC136Q96JN2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms