Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VCPIP1Q96JH7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms