Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG3Q96JB2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms