Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCC12Q96J65 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABCC12Q96J65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms