Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF496Q96IT1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF496Q96IT1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms