Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NEIL1Q96FI4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NEIL1Q96FI4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms