Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC97Q96F63 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms