Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RTP4Q96DX8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms