Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX21Q969T3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms