Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSR2Q969E8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms