Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHF3Q92576 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms