Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C11orf40Q8WZ69 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms