Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHDC4Q8TBB5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHDC4Q8TBB5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms