Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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SMIM20Q8N5G0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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SMIM20Q8N5G0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
SMIM20Q8N5G0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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