Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SYCP3Q8IZU3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP3Q8IZU3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms