Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KCNMB4Q86W47 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCNMB4Q86W47 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms