Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
N4BP2Q86UW6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
N4BP2Q86UW6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms